Innovar permanentemente las normas, métodos y técnicas para la salud en el campo de la pediatría.

Alcanzar y difundir los resultados de las investigaciones cientificas encargadas por la Alta Dirección y Direcciones Generales técnico-normativas del Ministerio de Salud.

Incrementar continuamente la calidad y productividad de la investigación especializada en el ámbito de la pediatría.

Mantener la eficacia, calidad y eficiencia en la prestación de servicios especializados de salud pediátrica.

Adquirir y aplicar nuevos conocimientos científicos y tecnológicos de la investigación y atención especializada de salud en el campo de la pediatría.

Establecer relaciones de cooperación científica y tecnológica con la comunidad científica nacional e internacional, en el marco de sus objetivos funcionales a través de la Alta Dirección del Ministerio de Salud.

Capacitar a los profesionales de la salud y técnicos del sector, con nuevos conocimientos científicos y tecnológicos, adquiridos de la investigación y atención especializada en el campo de la pediatría.